Séminaire de recherche au LBCM autour de Clément Offret

Retour sur le séminaire de recherche autour de Clément Offret

Le microbiote des invertébrés marins : structure et rôle écologique 

Dans un contexte où les animaux marins sont soumis à d’importantes modifications environnementales, il est nécessaire de comprendre quels sont les facteurs ayant un impact sur leur santé et leur capacité d’acclimatation. Les microbiotes associés à ces organismes jouent un rôle majeur dans la physiologie de l’hôte et dans ses capacités de résistance aux infections. L'habitat dans lequel évoluent les invertébrés marins est sujet à d'importantes variations biotiques et abiotiques. Dans ce contexte, il est important de connaître les conséquences sur la structure du microbiote ainsi que son rôle écologique chez leur hôte face à de telles fluctuations environnementales.

À l'heure actuelle, peu d'études traitent du microbiote digestif des bivalves et notamment de l'effet de l'habitat sur sa structuration. Après 4 mois d'implantation sur l'estran, la structure du microbiote digestif de la palourde japonaise Ruditapes philippinarum et de l'huître creuse Crassostrea gigas a été analysée par une approche de metabarcoding. L'analyse des données de séquençage à haut débit a ainsi permis de mettre en évidence une spécificité d'hôte et des modifications du microbiote sur des échelles spatiales et temporelles fines.

Le rôle d'un tel microbiote chez des invertébrés marins a également été appréhendé à travers la fonction de bouclier microbien. Il a ainsi été montré par approche cultivable que plusieurs espèces de mollusques et d'échinodermes hébergent au sein de leur liquide circulatoire un microbiote présentant des activités antimicrobiennes in vitro. In vivo, lorsque retrouvée dans l'hémolymphe d'ormeaux, la souche antibactérienne Pseudoalteromonas hCg- 6 limite de façon significative les mortalités de ce mollusque liées à la présence du pathogène Vibrio harveyi ORM4. L'ensemble de ces données sur le microbiote des invertébrés marins soulève des problématiques nouvelles, notamment sur la contribution de ces microbiotes pour la fitness de leur hôte. Toutefois, une vision holistique s'impose pour comprendre les interactions
complexes entre l'hôte, le microbiote et leur environnement.